Изследователите са създали това, което според тях са "едно гише" за диагностициране на инфекции – тест, който може да определи цялостната вирусна история на индивида само чрез сканиране на една капка кръв.
Тестът, наречен VirScan, е създаден от Стивън Елендж и колеги от Медицинския институт Хауърд Хюз (HHMI).
"Разработихме методология за скрининг, за да погледнем назад във времето в кръвните серуми на хората и да видим какви вируси са преживели", обяснява Elledge. "Вместо да тестваме по един индивидуален вирус наведнъж, което е трудоемко, можем да анализираме всичко това наведнъж. Това е едно гише".
Екипът обяснява как VirScan работи в ново проучване, публикувано в списанието, в което те разкриват и теста, който се извършва при тестването на кръвни проби на повече от 500 участници, заразени с определени вируси.
Elledge и колегите си синтезират над 93 000 къси сечения от ДНК, за да създадат теста, като всеки раздел кодира различни парчета вирусни протеини, наречени пептиди.
След това екипът въведе ДНК секциите на бактериофаги – вируси, които нахлуват в бактериални клетки и ги заразяват. Всеки бактериофаг се формова с пептид, като пептидът се показва на повърхността на бактериофага.
Заедно бактериофагите показват всички протеинови последователности, присъстващи в повече от 1000 щама на човешки вируси, известни понастоящем.
Обяснявайки как VirScan идентифицира вируси в кръвни проби, изследователите отбелязват, че антивирусните антитела, присъстващи в кръвта, разпознават уникални характеристики, известни като епитопи, които се намират в пептидите на повърхността на всеки бактериофаг. Когато бактериофагите се комбинират с кръвна проба, антителата в кръвта се идентифицират и се свързват с тези епитопи.
След това изследователите събират тези антитела и се разпореждат с всичко, с изключение на бактериофагите, към които са прикрепени.
Чрез провеждането на ДНК секвениране върху тези бактериофаги, екипът е в състояние да идентифицира пептидите, на които се придържат антителата, като разкрива кои вируси имунната система на индивида е попаднала преди това, било чрез инфекция или ваксинация.
Вероятно ще отнеме около 2-3 дни за VirScan да анализира 100 кръвни проби, според Elledge, въпреки че е уверен, че това време за обработка може да се увеличи, колкото повече се развива тестът. Би трябвало да струва около 25 долара за анализ на една кръвна проба.
Тестът показва висока чувствителност и специфичност
Изследователите са изследвали VirScan върху кръвните проби от 569 души от САЩ, Южна Африка, Тайланд и Перу, всички от които са били заразени с определени вируси, включително вируса на човешката имунна недостатъчност (ХИВ) и хепатит С.
Като цяло VirScan анализира около 100 милиона възможни взаимодействия между антитела и епитопи от кръвните проби, като тестът дава много точни резултати, според екипа. Elledge казва:
"Бяхме в диапазона на чувствителност от 95-100% за [ХИВ и хепатит С], а спецификата беше добра – ние не идентифицирахме фалшиво хора, които бяха отрицателни. Това ни даде увереност, че можем да открием други вируси и кога ние ги видяхме, щяхме да знаем, че те са истински. "
Екипът установи, че всяко лице, включено в проучването, има средно по 10 различни вируса, като хората в Южна Африка, Перу и Тайланд притежават антитела срещу повече вируси, отколкото тези в САЩ.
Освен това те установили, че възрастните притежават антитела срещу повече вируси, отколкото деца, а лицата с ХИВ имат антитела срещу повече вируси, отколкото тези без ХИВ.
Може би най-изненадващият извод обаче е, че отговорите на антитела срещу определени вируси са сходни за всеки индивид; антителата на различни хора разпознават точно същите аминокиселини, присъстващи в пептидите на специфични вируси.
Изследователите са убедени, че VirScan може да бъде ефективна алтернатива на съществуващите методи за вирусни тестове, които тестват поотделно вируси един по един.
Тъй като тестът може да определи вирусната история на индивида, екипът вярва, че той предлага потенциал за разкриване на фактори, които влияят на здравето, които може да са били пренебрегвани. Тестът също така дава възможност за оценка и сравнение на вирусни инфекции при големи популации и може дори да има отражение върху дизайна на ваксината.
Изследването им, според изследователите, им е помогнало да подобрят точността на VirScan и се надяват, че ще се подобри допълнително с повече изследвания.
Подходът, използван за създаване на VirScan, може да се приложи и за идентифициране на други антитела, отбелязва екипът, като тези, които участват в автоимунни заболявания, при които имунната система атакува здравите тъкани на организма.
